结球甘蓝SET基因家族鉴定与表达分析

摘要：

植物SET基因是一类含有SET结构域的高度保守的基因家族,参与调控植物多种生命过程.为探讨结球甘蓝SET基因家族及其表达情况,采用生物信息学方法对SET基因家族进行鉴定,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和半定量PCR(RT-PCR)对SET基因在不同组织中的表达模式进行分析.结果鉴定出28个结球甘蓝SET基因,它们不均匀分布在除1号染色体外的其他8条染色体上,编码蛋白的相对分子质量在29.20～185.16kDa之间,预测等电点在5.02～9.06之间.基因结构分析表明结球甘蓝SET基因有0～23个内含子.系统进化分析将该家族成员分为7个亚族,其中第Ⅱ和第V亚家族成员最多.在7个亚家族中,每个家族挑选1个基因,qRT-PCR结果显示选取的7个SET基因在结球甘蓝的叶片中不表达,而在根、茎、花蕾和花中均有表达,其中花蕾中表达量较高,进一步RT-PCR检测发现其在花粉母细胞时期高度表达.对结球甘蓝SET基因家族进行了鉴定,分析其进化关系和表达模式,可为深入研究该家族基因功能奠定一定的理论基础.

关键词：结球甘蓝、SET结构域、基因家族、表达分析

所属期刊栏目：49

分类号：S635.1(蔬菜园艺)

资助基金：国家自然科学基金31872108;31272170

在线出版日期：2022-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：424-431