核盘菌磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶编码基因的预测与生物信息学分析

摘要：

为了解磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶(PPTases)在核盘菌生理代谢与致病过程中的作用,在核盘菌全基因组中寻找PPTases同源物.利用同源比对的方法,预测出核盘茵中PPTases基因,进而分析其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、二级、三级结构和保守结构域,并对PPTases编码氨基酸进行遗传进化分析.结果表明,在核盘菌全基因组中预测存在3个PPTases基因同源物,分别命名为:Ss-Ppt1、Ss-Ppt2和Ss-Ppt3.3个蛋白均为亲水性的非分泌型蛋白,在其二级和三级结构中α螺旋结构和无规则卷曲占主要部分,且三者都含有PPTases的保守结构域SCOP和(或)ACPS.

关键词：核盘菌、磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶、生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：Q949.32;Q811.4(植物学)

资助基金：国家公益性行业农业科研专项201103016,安徽省现代产业油菜体系专项和2014年宿州区域发展协同创新中心全国开放课题2014SZXTKF04ZD共同资助.

在线出版日期：2016-08-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：359-365