河南斗鸡线粒体D-loop区多态性及与4种斗鸡的进化分析

摘要：

对28只河南斗鸡线粒体基因组(mitochondrial genome,mtDNA) D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank中其他品种中国斗鸡D-loop区序列,进行序列比对和进化分析.结果发现,河南斗鸡mtDNA D-loop区全长1232bp,单倍型多样性(Hd)为(0.542± 0.086),核苷酸多样性(Pi)为(0.00236-0.00083),共发现9处单核苷酸多态位点,3种单倍型.品种间进化分歧显示,河南斗鸡和西双版纳斗鸡遗传距离最近(0.0095),与漳州斗鸡遗传距离最远(0.0226).系统发育分析发现,5个斗鸡品种可以分成A、B、C、D和E5个分支.研究表明,河南斗鸡mtDNA D-loop区呈中度多态,有2个母系起源,本研究可以为河南斗鸡的遗传资源保护和选育提供一定参考.

关键词：河南斗鸡、线粒体DNA、D-loop区、多态性、起源

所属期刊栏目：42

分类号：S831.99(家禽)

资助基金：国家自然科学基金31372277资助.

在线出版日期：2015-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：726-729