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水稻组蛋白脱乙酰化酶SIR2的功能注释分析

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依赖于NAD+的组蛋白脱乙酰化酶SIR2对酵母和哺乳动物细胞的存活、衰老、凋亡等生理活动的调节起着重要的作用.利用生物信息学方法对SIR2在水稻中的生物学功能进行研究.结果表明,SRT701和SRT702分别位于第4条和第12条染色体上;它们编码的蛋白均含有N-糖基化、蛋白激酶C磷酸化、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化和豆蔻酰化4个相同的位点;SRT701主要位于细胞核,而SRT702主要位于内质网,它们均有跨膜区,且为疏水性蛋白质,都无信号肽;多序列比对发现植物SIR2家族的SIR2结构域高度保守;电子表达谱分析发现SRT701主要表达于叶片和花序,SRT702表达于整个植物中.利用RT-PCR方法进行检测的结果表明,SRT701在水稻根、茎、叶中均有表达,而SRT702只在叶、茎中有表达,根中没有表达,说明利用生物信息学方法所得的结果只能作为初步预测.水稻SRT701和SRT702器官特异性的表达模式表明它们可能在组织或器官形成中起着重要作用.

组蛋白脱乙酰化酶、生物信息学、SIR2、RT-PCR

35

S511.01;Q-3(禾谷类作物)

国家自然科学基金30471002;广东省自然科学基金05103637;华南植物园科研启动经费0553011001

2008-04-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共6页

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安徽农业大学学报

1672-352X

34-1162/S

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2008,35(1)

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