基于SLAF-seq简化基因组技术的疆岳驴遗传进化分析

摘要：

畜禽资源是中国种业创新、打赢种业翻身仗的根基.疆岳驴是陕西关中驴(大型驴)和新疆驴(小型驴)经过半个多世纪杂交改良、横交固定、选育提高、培育而成的良种驴,旨在基因组水平上揭示疆岳驴的遗传进化,解析疆岳驴的遗传结构及遗传多样性.该研究利用SLAF-seq简化基因组测序鉴定疆岳驴SNP标记,构建125头样品群体进化树并进行分析.共鉴定SNP标记4887196个;通过MEGA 5软件neighbor-joining算法,构建的群体进化树显示,125头疆岳驴聚集为2个大的分支:一个分支46头聚集在一起,亲缘关系较近;另一分支79头聚集在一起,亲缘关系较近.这2个分支间亲缘关系较远.通过admixture软件、EIGENSOFT软件、SPAGe?Di软件进一步佐证了125头疆岳驴可分为2个群体,利用SLAF-seq简化基因组测序能全面准确地揭示疆岳驴的遗传多样性和遗传结构,为疆岳驴的关联遗传学研究和重要性状QTL定位提供依据,为争取在第3次全国畜禽遗传资源普查申报新培育品种(配套系)和疆岳驴重要性状QTL定位奠定基础.

关键词：疆岳驴、简化基因组技术、遗传进化分析

所属期刊栏目：29

分类号：S822(家畜)

资助基金：自治区公益性科研院所基本科研业务经费;自治区重点研发计划项目;自治区重点研发计划项目;自治区自然基金

在线出版日期：2023-03-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：15-18,32