龙眼Myb-related-R1的克隆及生物信息学分析

摘要：

目的:以龙眼成熟叶片为试验材料,研究Myb-related基因在龙眼中的表达情况,初步推出侧该基因的功能.方法:通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼Myb-related R1基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析.结果:Myb-related-R1基因与SANT超家族基因片段有相似之处,ORF长度为879bp,编码292个氨基酸,有1个Myb结合位点.该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞核,存在35个氨基酸磷酸化位点.其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明,该基因与阿月浑子蛋白组亲缘关系最近.结论:根据其他物种该基因的功能及生物信息学软件预测结果,可初步推测该基因功能与染色体端粒结构有关,且与花青素合成有关.

关键词：龙眼、基因克隆、Myb-related-R1、端粒

所属期刊栏目：26

分类号：S667.2(果树园艺)

资助基金：国家荔枝龙眼产业技术体系;国家现代农业产业技术体系广西荔枝龙眼创新团队

在线出版日期：2020-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：12-16,32