10.3969/j.issn.1007-7731.2020.08.004
圆臀大黾蝽线粒体基因组密码子偏好性与COI基因适应性进化研究
利用CodonW、MEGA、EasyCodeML、CAIcal等软件及在线程序分析密码子偏好性相关参数(GC含量、ENC值、CAI值和CBI值),以明确圆臀大黾蝽线粒体蛋白编码基因的密码子使用偏好性和COI基因的适应性进化.通过中性绘图和ENC-plot分析了密码子偏好性的形成原因,采用位点模型研究COI基因的选择压力.结果表明,多数最优密码子以U结尾,RSCU值较高的密码子大部分都以A/U结尾;中性绘图和ENC-plot分析表明密码子偏好性主要受选择压力的影响;选择压力分析表明COI基因受到较强的纯化选择的作用,没有发现正选择位点.
圆臀大黾蝽、线粒体、密码子偏好性、COI、选择压力
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S432.44;Q78(病虫害及其防治)
山西省高等学校科技创新项目;忻州师范学院院级科研基金资助项目
2020-05-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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