基于TCGA数据分析CX43表达在胶质瘤中的临床意义及其与免疫细胞浸润的关系

摘要：

目的:探讨连接蛋白43(CX43)基因表达在胶质瘤中的临床意义、预后价值及其在肿瘤免疫微环境中的作用.方法:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库胶质瘤病人的mRNA数据及相关临床信息,利用R语言统计分析CX43基因在592例具有不同病理特征的胶质瘤患者间的表达差异.采用Kaplan-Meier生存分析法评价其预后价值,基因集富集分析(GSEA)探究CX43在胶质瘤中的潜在作用机制,用CIBERSORTx分析CX43 mRNA与胶质瘤免疫细胞浸润的关系.最后利用34例术后石蜡标本进行免疫组化验证分析.结果:与对照组比较,CX43 mRNA在异柠檬酸脱氢酶野生型、染色体1p/19q无共缺失的样本中表达水平显著升高(P<0.01).CX43高表达的胶质瘤患者预后较差(P<0.01).GSEA结果提示CX43 mRNA高表达组在9个特征基因集中富集.CIBERSORTx免疫浸润分析提示CX43 mRNA高表达组中单核细胞、巨噬细胞M2表型、活化树突状细胞显著升高(P<0.05).免疫组化结果提示CX43蛋白高表达与1p/19q无共缺失相关,并伴CD163阳性的M2样巨噬细胞增多.结论:CX43高表达与胶质瘤1p/19q无共缺失病理分型相关,为胶质瘤不良预后因子,且可能具有诱导巨噬细胞向M2表型极化的作用.

关键词：连接蛋白43、胶质瘤、免疫浸润、癌症基因组图谱

所属期刊栏目：33

分类号：R739.41(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;广东省自然科学基金;广东省人民医院登峰计划青苗项目

在线出版日期：2021-08-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：250-254,261