基于TCGA数据库分析肿瘤突变负荷在肌层浸润性膀胱癌预后评估中的价值

摘要：

目的:探讨肿瘤突变负荷(TMB)在肌层浸润性膀胱癌(MIBC)预后评估中的价值.方法:从TCGA数据库下载MIBC测序数据,结合临床数据分析TMB在MIBC中的临床意义,从TMB分组中识别出差异表达的免疫相关基因进行预后分析;另外采用非负矩阵分解CIBERSORT算法确定免疫细胞与TMB亚型之间的相关性.结果:纳入的375例MIBC患者样品中单核苷酸多态性(SNP)和C>T是最常见的错义突变;TP53、TTN、KMT2D、MUC16、ARID1A基因的突变率较高;与低TMB组MIBC患者相比,高TMB组的患者预后较好(P<0.01);以KIR2DL4、IL1RL1、SSTR5构建的COX回归模型中低风险组MIBC患者较高风险组预后更佳,曲线下面积(ROC)为0.71;与正常膀胱组织相比,高TMB组的CD8+T细胞、活化的CD4+T细胞、嗜酸性粒细胞表达较高,而在低TMB组中记忆B细胞及未活化的肥大细胞表达比例较高(P<0.05).结论:TMB较高的MIBC患者可能在免疫治疗中获得较好的预后,TMB具有预测肿瘤免疫治疗疗效的潜在应用价值;还发现了不同组分的免疫细胞在TMB分组的MIBC肿瘤微环境中存在表达差异.

关键词：肌层浸润、膀胱癌、肿瘤突变负荷、TCGA、预后

所属期刊栏目：32

分类号：R730.2(肿瘤学)

资助基金：广西省自然科学基金;广西卫生健康委员会科研课题

在线出版日期：2020-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：430-437,443