10.3969/j.issn.1004-616x.2020.02.008
数据挖掘分析SLC7A11在食管癌中的表达及通过P53/ROS通路调节细胞铁死亡的意义
目的:分析溶质运载蛋白7家族成员11(SLC7A11)在食管癌(ESCA)组织中的表达与功能,及对患者生存预后的影响.方法:基于Oncomine及GEPIA数据库,检索SLC7A11在ESCA组织与正常食管组织中的表达差异;采用GeneMANIA数据库构建有关SLC7A 11的蛋白互作网络(PPI),并进行功能注释分析其共同富集的生物学功能;通过KEGG Pathway数据库分析其参与的信号通路;利用R2基因分析可视化平台,绘制Kaplan-Meier函数曲线,分析SLC7A 11的表达对患者生存预后的影响.结果:Oncomine及GEPIA数据分析显示,SLCTA11在ESCA组织中mRNA的表达水平较正常组织显著升高(P<0.05),且高表达组患者生存预后较差,差异具有统计学意义(P<0.05);SLC7A 11与SLC3A2、BSG、ASNS、PHGDH、TERT、CD44等20种蛋白相互作用,主要富集于氨基酸转运、修饰氨基酸的跨膜转运活性、白细胞游走、多肽抗原绑定等生物学功能;SLC7A 11通过P53/ROS信号的活化介导细胞铁死亡信号通路(hsa04216)的调节.结论:SLC7A11在ESCA组织中表达升高,且高表达组患者预后不良;SLC7A 11可能通过P53、ROS代谢通路参与细胞铁死亡,有望成为ESCA患者早期诊断、治疗及判断预后的分子靶标.
食管癌、溶质运载蛋白7家族成员11、数据挖掘、铁死亡
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R735.1(肿瘤学)
恩施州医疗卫生类指导性项目JCY2019000029
2020-05-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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