长链非编码RNA与mRNA在胰腺癌中的差异表达及其预后价值

摘要：

目的:对基因芯片表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的胰腺癌数据进行生物信息学分析,探讨长链非编码RNA(lncRNA)与mRNA在胰腺癌中的差异表达和预后价值.方法:首先对GEO数据库中的胰腺癌数据注释获得mRNA和lncRNA,并对芯片中的mRNA和lncRNA取交集获得差异mRNA和lncRNA.然后对差异mRNA和lncRNA进行基因分析,同时对TCGA数据库中胰腺癌的相关数据进行生存分析.结果:通过基因分析获得与胰腺癌相关可信度高的差异mRNA 1147个,lncRNA 336个,通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,构建lncRNA-mRNA共表达网络、lncRNA-mRNA-pathway网络、信号通路关系网络及蛋白质相互作用网络,结果证明mRNA和lncRNA对胰腺癌的发生发展有着重要影响;生存分析发现有12个lncRNA与胰腺癌的预后相关,分别是ATP1A1-AS1、CBR3-AS1、CTD-3080P12.3、FAM66D、FAM87A、FLJ38576、LINC00476、LINC00574、LINC01554、PYY2、LINC00857、OVOL1-AS1.结论:lncRNA对胰腺癌的发生发展及预后有显著影响,有望为胰腺癌的靶向治疗和预后评估提供新的治疗靶点和分子标志物.

关键词：胰腺癌、长链非编码RNA、mRNA、预后评估

所属期刊栏目：31

分类号：R318.04(医用一般科学)

资助基金：国家自然科学基金项目71373042

在线出版日期：2019-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：119-126,132