应用质谱技术检测结肠癌细胞DPYD和MTHFR基因单核苷酸多态性

摘要：

目的:检测结肠癌细胞株中两种代谢相关基因DPYD和MTHFR的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs).方法:培养HT-29及Lovo两株结肠癌细胞,分别提取基因组DNA,PCR扩增DPYD和MTHFR基因相应目的片段,采用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术进行DPYD因rs1801159(A/G)、rs1801160(G/A)、rs17376848(A/G),MTHF基因rs1801131 (A/C)、rs1801133 (C/T)、rs2274976 (G/A)的SNPs位点检测.结果:两种细胞的DPYD基因3个位点rs1801159、rs1801160及rs17376848基因型均为野生纯合型,即A/A、G/G及A/A型.HT-29细胞MTHFR基因rs1801131和rs1801133、rs2274976位点基因型分别为A/C、C/T杂合子和G/G纯合子,而Lovo细胞此3个位点依次为A/A、T/T纯合子和G/A杂合子.结论:本实验中HT-29及Lovo两种细胞株的DPYD基因所测3个SNP位点基因型均相同,而这两种结肠癌细胞株MTHFR基因所测的各SNP位点基因型均不相同.

关键词：结肠癌、单核苷酸多态性、DPYD、MTHFR

所属期刊栏目：24

分类号：Q754(分子遗传学)

资助基金：国家自然科学基金项目30872970,30740062;江苏省科技厅重大项目EM2006111

在线出版日期：2012-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：96-99,107